Folyamatosan frissített 12.04 akadozás

Ötleteket kérek, adott egy folyamatosan frissített 12.04 (64 bites)
és valamikor kb. 2-3 hete egy frissítés óta mintha meg-meg akadna a rendszer működése.
Nézegettem a logokat de semmi hibára utaló gondot nem találtam.

A jelenség: teljesen átlagos használat mellett (web-játék-film) random megakad a rendszer működése pártized másodpercre, mintha szaggatna egy film, és ezalatt a pár pillanat alatt semmire nem reagál a gép, aztán minden megy tovább...
Először a böngésző + flashre gyanakodtam, de aztán játék és filmnézés közben is produkálta ugyanezt a jelenséget.
Gondoltam már túlmelegedésre is de mindenféle hőmérő szerint minden rendben van, vga átlag 30-50 fok körül van terheléstől függően, processzor is szintén, ventiknek semmi fura hangja, áram sem ingadozik.
Keresgéltem a jelenségre de mindenhol csak akadozó flashre, és hd videókra találok megoldásokat.
A "másik tartalék rendszer" ami egy Debian/Squeeze nem produkál ilyesmit a gép, ezért biztos hogy valami szoftveres dolog lesz.

Mindez Unity3D-vel történik, 2D-t még nem próbáltam, mert hiszen ha eddig működött akkor most is működnie kellene, tehát hiba keresés és nem költözés.
A rendszer szinte teljesen gyári, semmibe sem turkáltam kézzel, mindent hagytam hogy az Ubuntu állítgasson be, eddig jó is volt minden...

Laptopon szintén 12.04-et használok és ott is up to date minden, de nincs semmi hasonló jelenség. (Intel+Geforce páros szintén)

Az érintett gépről nagy vonalakban:
i5-760/ 8gb ram/ GT240 vga/ Intel H55 chipset
WD-GREEN merevlemez

Minden ötletet várok, és tapasztalt már valaki ilyet? vagy ehhez hasonlót?