Sziasztok,
a következőben szeretnék segítséget kérni. Debian alá szeretnék NMR spektrum elemzéséhez alkalmas programot. Win alatt a MestRe-C-t használjuk. Van linuxos változata is, csak 45 napos próbaidővel. Ehhez keresek valami alternatívát. Általános dolgokat kellene tudnia: FID FT-ja, fázisolás, peak picking, integrálok, egyebek. Ne javás legyen, arról meg már lemondtam, hogy benne legyen vmelyik Debian tárolóban. Ha lenne deb vagy rpm, az jó lenne, de nem létszükség. Eddig a matNMR-t és a relax-ot találtam. Az előbbihez matlab kell, ami nincs, az utóbbi függőségeit feltettem, amit a honlapon írtak, de syntax errorral elszáll.
Egyelőre a 45 napos próbaidős MestRe-C tűnik ideálisnak. Szóval ha valaki ismer esetleg valami alternatívát, kérem, ossza meg.
Szerk: a FID-et egy 250-es Brukerhez adott szoftver állítja elő, ezt kellene tudnia kezelnie.
Szerk2: Első körben elég, ha 1D-s NMR spektrumot kezel.
Köszönöm
Dani
- 1094 megtekintés
Hozzászólások
Hello!
Én ESR-rel foglalkoztam de mi többnyire saját belső parancssoros progikkal kezeltük a spektrumokat, meg persze awk és gnuplot über alles, esetleg ez is egy járható út.. Talán fapadosnak tűnik, de elég flexibilis ugyanakkor, nem vagy a programozó fantáziájához kötve.
Zs
- A hozzászóláshoz be kell jelentkezni
Hát ha a szándék meglenne, sem tudnám, hogy nyúljak hozzá gnuplottal. Hozzáfogtam végigtúrni a az xwin-nmr által generált fájlokat, de használható dolgot még nem találtam. Most az nmrview-t nézegetem, de elsőre úgy tűnik, nem kezeli a fidet (ez valami bináris fájl, amit a mestrec gond nélkül kezel), ezen kívül javás. Próbálom valahogy konvertálni. Franc se gondolta, hogy így bele kell mászni.
- A hozzászóláshoz be kell jelentkezni
Küldök egy perl scriptet amit mi brukerből értelmes formátumba konvertálásra használtunk, nem tudom kezdesz-e vele valamit... próbát megér.
- A hozzászóláshoz be kell jelentkezni
Na azt nagyon megköszönöm.
- A hozzászóláshoz be kell jelentkezni