Már miért lenne a git-en vírusos a zip? Egyébként ha Linuxon vagy, akkor ne a zip-et töltsd a git-ről, hanem a git csomagot feltelepítve add ki a git clone https://url-bla-bla.bla/bla/bla parancsot, az szépen leklónozza neked a tárolót egy mappába, amibe csak bele kell lépnek.
Sőt, normális Linux disztrón ennyi se kell, a tárolókban ott kéne legyen a yt-dlp-nek, simán csomagkezelővel telepíted.