maradj ext3-nál, mert azt sokan használják, van tapasztalat, hibák javítva és vannak hozzá tool-ok. Ha meg mégis gond van (nekem ebben a 3 évben nem volt, pedig nem egy gépen nyúztam), akkor sok embertől tudsz segítséget kérni.
Amit még ajánlok: soft raid mirror + lvm2, a raid-et csináld úgy, hogy 2 aktív eszköz + 1 spare és a két aktív eszközből is az egyiket missingre állítod. Így ha később lesz egy ugyanekkora hdd-d, akkor mellé rakhatod és azonnal megy a tükrözés, ha már hárman lesznek, akkor meg a harmadik hot spare lesz. Persze ezek alá nagyon erősen ajánlom az UPS-t, mert több rétegen keresztül történik pufferelés a memóriában és ha nincs szabályosan leállítva a rendszer (pl. áramszünet miatt), akkor érhetnek meglepetések: még umountolt fájrendszer is megsérülhet ha az umount után, de még a lvm vagy a raid puffer ürítése előtt jön egy áramszünet. Ezt tapasztalatból írom!