Választhatod a FreeBSD vagy a TrueOS-t, de akár a NetBSD-t, OpenBSD-t vagy DragonFly-t is.
A legelterjedtebb közülük a FreeBSD, amely minden felhasználóbarát (csomagkezelő, telepítő) GUI-t nélkülöz. Ha nem ijedsz meg a parancssortól, szerintem ez a legjobb választás.
A TrueOS egy FreeBSD alapú rendszer, némi grafikus eszközzel megbolondítva.
A FreeBSD igen jó dokumentációval rendelkezik (van magyar nyelven is, ami itt-ott elavult). A doksi kitér a telepítésre is, szerintem abban mindent megtalálsz, ha mégsem, akkor keresel/kérdezel :)
Fájlrendszerből olyan sok választás nincs, leginkább UFS és ZFS, utóbbit akár ismerheted is.
Linux és FreeBSD közös fájlrendszere (mondjuk a home-ra gondolok) kb. a ZFS lehet, az UFS Linux alatt (amennyire tudom) experimental, az XFS, JFS, ReiserFS, ext4 pedig FreeBSD alatt nincs (vagyis csak korlátozottan), talán az ext3 még szóba jöhet.
Érdemes megpróbálni, 2013 óta csak FreeBSD van a gépeimen (két laptop, egy ősrégi asztali gép, VPS-ek, egy RPi), nekem jobban bevált.