"Na ebben fos a git, akárhány GUI-t próbáltam hozzá, mindnek más a terminológiája, az azonos műveleteket másképp kell végrehajtani velük, és nem találtam olyan tool-t, ami rendesen működik Win-en és Linux-on is."
A beépítettet (git-gui) nem próbáltad? Az működik rendesen Linuxon és Windowson is, ugyanaz a terminológiája és ugyanúgy kell a műveleteket is végrehajtani.