Tudom én használni a Gconf-ot, szoktam is, és tényleg hasznos (is lehet) hogy egy sorral terminálból ki lehet adni a config módosítást, és nem kell fájlt túrni. De ettől függetlenül tényleg kísértetiesen hasonlít a registryre.
Jó persze kevesebb szemét van benne, meg rendben van tartva, de ez nem a Gconfon múlik, hanem a fejlesztőkön.