Én azt csinálnám, hogy egy bat fájlba beletenném a futtatást és előtte átállítanám a kódlapot. Azért érdemes beletenni egy bat fájlba, mert ha így az egyes kimeneteket is ki tudod irányítani akár külön fájlba is. Például, ha a programban exception esetén az error -ra írsz (pl System.err.println("valami hiba")) és sikeres futás esetén az out -ra (pl System.out.println("valami sikeres")), akkor ezt a bat fájlban a futtatáskor a megfelelő fájlokba vagy képernyőre tudod irányítani.
De persze, lehet máshogy is. Ahogy neked "olcsóbb" a megoldás.
Ha a kódba is kell segítség, keress nyugodtan.