Tudom, ez nem segít a konkrét probléma megoldásában (clonezilla-t sosem próbáltam), de nem igazán értem azokat, akik ilyen toolokat raknak össze egyébként jól működő megoldásokat rosszul működő megoldásokkal eltakarva.
Linuxos rendszert én rendszerint rsync-kel mentek, ha fájl szinten kell (mondjuk egy másik gépre mentem, ami másik gép át kell tudja venni az elsőtől a szerepet), vagy dd-vel, ha disk image készítés a cél. Windows partíció tartalmát meg ntfsclone-nal (bár valószínű menne dd-vel is, de tetszik, hogy az ntfsclone az üres helyet nem menti, és az egyik formátumát fel is tudom mountolni, így ha kell 1-2 fájl egy mentett partícióból, azt ki lehet válogatni visszaállítás nélkül).
Ezeket a toolokat mind holt egyszerű használni, és még sosem volt gond a visszaállítással.