Raszteres (pixeles) térképek esetében a georeferálás GCP-k (Ground Control Point, magyarul földi illesztőpont) segítségével lehetséges.
Ezek gyakorlatilag a térkép egy egy pixelének (px,py) a cél vetületi rendszerbeli (pl wgs84, eov, stb) koordinátáit adják meg. A georeferáláshoz legalább kettő ilyen pont szükséges.
Mivel azt írtad, hogy nagyon sok ilyen képről van szó, így lehetséges, hogy a fájlnévből/útvonalból esetleg kikövetkeztethető a képek eredeti vetületi rendszere és a sarkainak eredeti vetületi rendszerbeli koordinátái. Innentől kezdve már "csak" egy kis programozás és a gdal megoldja.
Van az a pénz, amiért megcsinálom. Ha gondolod, keress privátban!