Mi a baj a sok apró file-lal?
Miért kell adatbázis? Akarod ezeket a fileokat indexelni, tartalom alapján szűrni, keresni bennük? Mert az adatbázis erre való. Strukturált adatok tárolására, és a strukturált adattáron végzett műveletekre.
Ha az a bajod, hogy sok apró file van, és nem 1 nagy, akkor használj TAR archívumot tömörítés nélkül arra, hogy egy nagy file-ként lássad, és tudj benne dolgozni.
Neked nem adatbázis kell, hanem archívum-formátum.