Az encfs jó kompromisszum lehet. Nem annyira biztonságos, mint a truecrypt, mert titkosított fájlok darabszámát és körülbelüli méretét ki lehet találni, de a pontos fájlnevet és a tartalmat az iparági standard AES256 védi. Cserébe, ha csak 1 fájl változik, akkor csak 1 fájl szinkronizálódik fel, nem az egész device. Van windowsos implementációja is, bár azt nem próbáltam. Androidon és Linuxon ment szépen.