a "grubnak csak a promptja jön be" az mit jelent? stage 1.5 loading?
a fenti rendszereket nem ismerem (mondjuk nagyon az ubuntut sem :), de ubuntunál szívtam már én is ezzel.
ebben az esetben grub menu.lst szerkesztés és írd át a root (hdx,x)-et hd(0,x)-re, a töltendő kernelnél használj uuid-t vagy labelt, fstab-ban is mindent uuid-vel vagy labellel, (mivel a bios megcseréli a merevlemezeket, és átírja a kiválasztott boot eszközt hd0-ra, függetlenül attól, hogy az éppen mondjuk hd3, de a kernel és uudev visszaállítja a valódi sorrendet). ezután a grub könyvtárbnan szintén, van egy device.map fájl (vagy valami hasonló), itt add hozzá az összes lemezt, úgy, hogy a pendrive legyen a hd0.
illetve nézd meg a fentieket a működő ubuntu pendrive-nál, és annak megfelelően csináld meg a másik pendrájvot is.