Ott nem az van, hogy a git tag bármi lehet, nem csak verziószám? Azaz logikus, hogy alfanumerikusan sortol és nem feltételezi, hogy version number minden tag. Vagy ahogy írod is, van rá git config opció (tag.sort version:refname). A human errort kiküszöbölendő lehet akár helper scripteket bevezetni a taggingre, de talán az jobb megoldás, ha a CI tagel és nem humán.