Igen. Én is erre gondolok. Ha nem szutyok javascript-tel oldanák meg az autentikálást könnyebb lenne a gtk alkalmazásfejlesztőknek is az élete...
De, hogy ontopic legyek, nem ismerem túl mélyen a gtk-s appok működését. De van otthon LinuxMint cinnamon gépem, ha hazaérek ránézek egy kicsit. Próbáltad a fent írt GDK_SYNCHRONIZE környezeti változóval debugolni?