Az ideális meg a nyílt forrású IDE jóideje (~10 éve?) az IntelliJ IDEA-nál leledzik. A CE edition Apache licenszes. Próbáltad már? Nagyságrendekkel jobb / erőteljesebben fejlődik. A NetBeans pár rajongó nyugdíjas projektje, senki sem veszi már komolyan. Már csak a Swing UI-ból is lejön, hogy egy legacy cucc.
És nem egészen értem hogy jön ide egy SFTP (amúgy SSH data channelről vagy SSL FTP-ről van szó?). Azt külön bármilyen progival megoldod.