Azt is megnéztem. Jelen esetben nincs jelentősége a sorrendnek. Másrészt a babel csomag a dokumentum egészére nézve definiál dolgokat, így azt mindig célszerű mindig a preambulum elején elhelyezni. Ugyanez vonatkozik az inputenc és fontenc csomagokra is.
A sorrend akkor szokott számítani, ha az egyik csomag épít a másik által nyújtott funkciókra.
Most az lehet a baj, hogy a babel a nyelvi beállításoktól függően megváltoztatja a fejezetcímek kinézetét és elhelyezkedését, és erre nincs felkészítve a fncychap csomag. Azaz a babel-ben módosított dolgok egy részét felülvágja a fncychap.