A /media/valami még a régi udisks volt, azóta fejlesztettek rajta :)
Az újban egyébként meg kell adni, hogy x-gvfs-show az fstab mount opciói közt, és akkor elvileg látszik a GUI-n is. A mount pointot meg megcsinálja, csak célszerű nem a /run/media-t használni, hanem pl. az /mnt-t. Mindez nagyon szépen beállítható a gnome-disksben, ha nincs kedve az embernek vi-ozni. Kipróbáltam, csináltam egy ilyet az /etc/fstab-ba (illetve a gnome-disks csinálta):
/dev/disk/by-id/usb-UFD_3.0_Silicon-Power8G_121001240540000034-0:0-part1 /mnt/usb-UFD_3.0_Silicon-Power8G_121001240540000034-0:0-part1 auto nosuid,nodev,nofail,noauto,x-gvfs-show 0 0
Ez egy 8 gigás pendrive, user tudja mountolni, a megadott helyre, a megadott mount opciókkal, mindezt GUI-ból. Szóval van remény!