Én egy jó pár éve játszottam a témával, mondjuk gentoo alatt. Pontosan, hogy mit csináltam arra nem emlékszem (sajnos), de az tuti, hogy a kártyára sikerült PIN kódokat létrehoznom és abba kerültek tanúsítványok.
Ennél windows alatt mostohább volt a helyzet, ugyanis hiába kaptam valami safesign nevű csodaszoftvert, az max arra volt jó, hogy olvassam a kártyákat, az íráshoz valami más verzója kellett. Természetesen ezek mind fizetős szoftverek, amiket nem is "találtam" meg sehol.
Amire még tuti emlékszem, hogy a linux alatt felírt PIN kódok közül a windows csak az elsőt látta, és emiatt jókat szívtam.
Ez nem sok infó, de hátha elég ahhoz, hogy tovább lépj :)