Nekem hasonló felállásom van Linux alatt (MythTv tök jól megy). Csak egy kérdés: miért akarod állítgatni a frekvenciákat? Nekem régen Nvidia kártyám volt, és azon mintha nem ment volna az xrandr (tessék a gyártónál drivert reklamálni). Én simán beállítottam az xorg.conf-ban a frekvenciákat azt ment. Igaz, ha lekérdeztem akoor baromságokat írt ki.
Hogy a kérdésre is válaszoljak: Szerintem valami xorg.conf beállítás fog hibádzni.