Egyszerűbb volt a megoldás mint gondoltam, egy make extract után az ajánlott patchet (http://svn.ruby-lang.org/cgi-bin/viewvc.cgi?view=rev&revision=18485) felraktam a forrásra. A fordítás és install simán lefutott, és eddig úgy tűnik minden működik megint. Ha nem lesz gond megy az éles rendszerbe is.
Ilyenkor azt, hogy a probléma megoldva nekem kéne kiírni a téma címéhez? :)