Egyébként miért ne fusson külön user-rel? Én több progit is így futtatok:
gksu -u guest program
Tök mindegy hogy hova írja nekem pl. a firefox a .mozilla könyvtárat. Viszont nem tud elérni semmilyen más felhasználó fájlokat. Nem mondom hogy kényelmes és szép megoldás, viszont néhány fajta programhoz megfelelő :)