Szerver jellegű alkalmazások futtatásáról nem tudok gyakorlati tapasztalattal szolgálni. De desktop téren számottevő sebesség növekedést tapasztalni 64 biten, az azonos gépen futtatott 32 bites rendszerhez képest. Core 2 duo-val teszteltem gentoo linuxon. A 64 bites rendszer gyorsabban bootol. Kde is. Programok forgatása is gyorsabbnak tűnik, de ezt nem lehet igazán korrekt módon letesztelni. Video kódolásnál kb 10-14% előnye van a 64 bites rendszernek. De csak a leg számításigényesebb feladatoknál jön ki ez az előny.
Vmware-t nem próbáltam, de a virtualbox-on futtatott xp villámgyorsan bootol és az alkalmazások is gyorsak. Igaz nálam 2GB a rendszermemória, és ebből a virtualbox 1GB-ot megkapott.
Ugyanakkor van néhány kellemetlen dolog is ami mellett nem szabad elmenni.
Az xvid kódolás kb 50%-al lassabb mint 32 biten. Ezt mencoder és avidemux használatával is tapasztaltam. Valami nagyon elszúrtak az xviddel és biztosan van még ilyen problémas program több is, csak én még nem találtam.
Más rendszeren nem volt alkalmam kipróbálni, de gondolom egyéb linuxokon is hasonló a helyzet.
64 bites böngészőhöz csak az nspluginwrapper-rel lehet flasht használni. Ami vagy működik, vagy nem...
Java plugin szintén nincs hivatalosan, bár az "icedtea" project már használható megoldást nyújt erre a problémára is.