Aki jó eredményt akar elérni annak úgyse jó az automatikus eltávolítás.
Van egy ilyen is:
http://gimps.de/en/tutorials/gimp/picture-photo-image/remove-red-eyes/i…
Meg van az F-spot is:
https://help.ubuntu.com/community/F-SpotHowto
Ez azt csinálja amit írtál. Kijelölöd a szemeket, kattintasz az ikonra és kész.