Nem kell telerakni a plain textet mindenféle szarral, csak lehet.
A html is jó, én használom is. Az pedig érv, hogy kevesebb gépelés kell, mivel a markdown megspórolja az egész <head> részt, a closing tageket, és tulajdonképpen a <p>-ket is.
A wysiwyg dolog pedig opcionális, szerintem rettentően lelassítja a gépelést, ha folyton abba kell hagyni, hogy egerészgessek.