Nincs valami olyan tranzakció esetleg, ami régóta fut? Mit mond a "show engine innodb status" ?
Hogyan tudom egyáltalán megnézni, hogy mi milyen arányban van ebben a fájlban?
Az "innochecksum /var/lib/mysql/ibdata1" megmondja, de ez csak lekapcsolt adatbázisszervernél lehetséges (amikor úgyis megszűnik a feltételezett kiváltó ok, mert a tranzakció rollbackelni fog).