Most meg ezt nem értem. Mint ahogy említettem, a dockernek az a lényege, hogy a host OS kerneljét használja. Windows alapú image-et natívan tudsz futtatni Windows-on a natív windows-os docker engine-nel és linuxon kellene virtualizálnod hozzá egy Windows VM-et. Az egy másik kérdés, hogy ez egy elég ritka use-case.
Szóval ez egy ilyen technológia, ha cross OS akarsz containert futtatni, akkor kell virtualizálnod egy olyan OS alapú VM-et, és ez független attól, hogy a host OS-ed Windows vagy linux. Ez nem a Windows hibája.