Azért továbbra is jobb félni, mint megijedni....
Azért szerintem Te is tudod, hogy a chkrootkit legalább fél éve, de inkább régebb óta ad fals pozitív riportokat FreeBSD rendszereken, lévén rendszeresen visszatérő kérdés pl. a FreeBSD-security-listán. De itt egy teszt:
a) előveszel egy Live-CD-t (ez lehet FreeSBIE, vagy akár a hivatalos CD-készlet második (un. helyreállító) CD-je), és azzal indítva a gépet letesztelni a gépben levő diszken levő dolgokat -, ahogy maga a chkrootkit oldalán levő FAQ is írja.
b) Lehet magát azt a Live-CD-t leellenőrizni, és ha arra is hibát ad, háááát ...
Persze abból kiindulva, amit írtál is a feltört mirrorokról, már az is lehet, hogy verziók óta rootkites FBSD szerverek és munkaállomások ezrei, milliói élnek szerte a világban :-)