bár nem olvastam végig az egészet, de szerintem blocksync lesz a barátod.
ez képes rsync-hez hasonlóan átmásolni az egészet SSH-n keresztül, majd csak a változásokat.
Azaz ha egy élő rendszert akarsz átvinni, akkor sync-eled az egészet - mire minden átér addigra "természetesen" lesz változás.
majd leállítod a szolgáltatásokat a forrás gépen, blocksync megint (itt már csak az időközben változott blokkokat viszi át) és a célgépen
fsck, mount után már indíthatod is a szolgáltatásokat.
https://www.ullright.org/ullWiki/show/blocksync-py