root-ként futtatva rscync.
Hogy nézzen ki a parancs? A felparaméterezéséhez javaslom a man olvasgatását. Van egy csomó különféle opció (pl. mit csináljon symlink esetén, mit csináljon hardlink esetén, van-e olyan fájl (backup fájlok, stb), amit nem kell másolni, stb. stb.
Én személy szerint valami ilyesmivel indulnék:
# rsync -a root@távoligép:/home /itt/backup/távoligép/