Én is az rsync -re gondoltam, de mondom hátha. Lokálisan, ha egy szűz diszkre másolsz ez egy jó megoldás.
INFO:
A két gép csak interneten kapcsolódik, a távoli szerver ck. 15Mb/sec uupload az én downloadom a csillagos ég. 254GB köztük Maildir -ek ami irtó sok kis fájl kellene átcígölni (nem számoltam utána, de lehet nem elég rá 24 óra ezen a sebességen).