Nem kérdeztél egyszerűt, szvsz elsőre fusd át ezt: https://www.ixsystems.com/blog/open-zfs-vs-btrfs/
Én látatlanban a ZFS-re szavaznék, de ez erősen függ attól, hogy milyen gépen akarod használni. A ZFS sokkal kiforrottabb, sokkal többen használják, nincsenek megbízhatósági problémái. Van viszont erőforrás és tudás igénye. A linux kernelbe legnagyobb bánatomra tényleg nincs közvetlenül benne, de ez a CDDL licenc miatt van és nem a minősége az ok. Úgy tűnik ez is változik mostanában, mert a FreeBSD, Proxmox (meg még jopár) után az Ubuntu is belerakja a distrójába.
A Btrfs-t is használják páran, pl Suse, Synology de a RedHat most dobta a támogatását.
A btrfs snapshot-ról meg ez elég sokat mondó:
https://wiki.debian.org/Btrfs
Insure that the number of snapshots per volume/filesystem never exceeds 12; two or three times that might not cause ill effects, but keeping the count in the small double digits provides the greatest odds for avoiding morbid performance issues and out of space conditions. On the upside, many more btrfs snapshots can be taken before performance crashes when compared to LVM snapshots, where a single snapshot can introduce a performance crash.
A ZFS snapshot száma nagyjából korlátlan. Egy kolléga rekordja 500+ volt, mert azzal (is) mentett, és nem volt érezhető teljesítmény csökkenés a gépén.
Ez meg igen jó cucc: https://github.com/zfsonlinux/zfs-auto-snapshot