Ebben az a poén, hogy PyGObject csomagot egy darabot sem telepítettem. Fogalmam sincs, hogy került a gépemre, de fenn van. :)
Gyanítom, a Unity egyik alkatrésze vagy más GUIs cucc hozta magával függőségként.
Egy apt-get autoremove --simulate python3-gi elég érdekes listát ad az automatikusan eltávolítandó csomagokról. Kb. a fél rendszer. :)