Nekem is volt vagy 2 éve hasonló problémám, de az egy FAT cserepartíció volt, ugyanis a FreeBSD és a Linux között ezen a partíción keresztül biztosítottam az "átjárást", a fájlcserét. Ugyanis a Reiser FS-t nem tudtam mountolni a FreeBSD alá és a Linux meg nem volt hajlandó (vagy csak én próbáltam rosszul) kezelni a Slice-okat.
Így jött egy régebben a /boot könyvtár alatt "szolgáló" partíció (hda1) a képbe, amit leformáztam FAT-ra és utána ha a bootolásnál automatikusan felcsatolódott, akkor hiába csatolta olyan könyvtár alá amelyik a
/home/user alkönyvtára volt, mert a felmountolás után már a root-é lett a könyvtár és ezért csak olvasni tudtam innen.
Én is nagyjábol azokat próbáltam végigcsinálni amit Te, ám nem segített. A megoldás az lett, hogy az /etc/fstab-ba noauto került a mountoláshoz és a "user"-t megmaradt a 4. oszlopban, ekkor ugyan kézzel kellett felcsatolni a partíciót, de USER-ként is ment az írás rá.