Úgy tudom, hogy az Adobe Reader nem a rendszer tanúsítványtárát használja, hanem sajátot, az AATL-t. Azaz hiába van benne a Windows tanúsítványtárban, vagy Linuxon az NSS database-ben az e-Szignó CA cert, nem mész vele sokra.
https://helpx.adobe.com/acrobat/using/trusted-identities.html
Ebben nincs benne a Microsec e-Szignó, szívás.
https://helpx.adobe.com/acrobat/kb/approved-trust-list1.html
A NetLock viszont benne van. Használjatok Netlockot PDF aláírásra.