"Ami nekem nem tetszik az ötletben, az a tárhelypazarlás, amit hozhat magával."
És ez senkit sem zavar egyik másik oprendszer alatt, pl osx, ahol hasonló elven egybe van csomagolva az alkalmazás a függőségeivel, ráadásul ha jól tudom régen mikor az intelre váltottak a régi és új platform binárisai is egy csomagban voltak. Windows alatt se sok vizet zavar, hogy minden app mellé be vannak csomagolva a függőségei (szinte).
Egy ideális világban jobb rendszer az, ami most van. a függőségek önálló csomagok, a disztribútor frissíti, minden csak egyszer foglal helyet. Cserébe csomó szívás van a verziók közti átjárhatósággal, elég csak megpróbálni felrakni egy modern programot egy régebbi ubuntu/debian verzióra, vagy fordítva.