Gyanítom, hogy a fejlesztésre használt FPGA-juk alapból tartalmaz egy 64bites PCI-X interfészt, azért használják azt.
Egyébként meg idézet a FAQ-ból:
*How about PCI Express?*
A PCI Express version will exist. PCI and AGP versions will come first though.
Tehát nyilván AGP-s (ami ugyebár alig több egy sima 32bites PCI-nál) majd később PCI express-es változat lesz.