Elmúlt 10 évnyi Java fejlesztésben csak a soros port kezelésnél tapasztaltam, hogy más jar-t kellett hozzá rakni Windowsnál, mint Linuxnál, máshol még még ennyi különbség se nagyon volt.
Nálunk minden fejlesztés vegyes környezetben történik, némelyek Windowson, mások Linuxon fejlesztik ugyanazt az alkalmazást.