Ha debian6 és ismeretlen amit írtam, akkor ne foglalkozz vele! ;)
SELinux és apparmor biztonsági eszközök, amivel még a root nevében futó processzek jogait is tudod korlátozni. Ha SELinuxod van, akkor a getenforce paranccsal tudod lekérdezni az állapotát: be van-e kapcsolva, ha igen, csak logolja az illetéktelen hozzáféréseket vagy meg is akadályozza?
Ugyanez a helyzet az apparmorral, csak az Ubuntun divat, meg talán SuSE Linuxon. És ott talán az aa_status mondja meg, hogy be van-e kapcsolva.
A "társai" meg arra vonatkozott, hogy van még pár hasonló eszköz, de azokról még annyit sem tudok, mint ezekről.
Egyébként javasolnám, hogy a /var/log alatt keresgélj a hozzáférési problémák miatt, valamelyik logban előfordulhat, hogy találsz valamit ami segít.