Tegyél a tree opciói közé egy -F kapcsolót is, akkor a sor végén lesz egy "/", ha könyvtárról van szó!
Így (nem tudnám a pontos regexp-t felírni) már megoldható a feladat.
A jelenlegi formával az a gond, hogy önmagában a 4.0K nem feltétlenül jelöl könyvtárat, tehát azt kicserélni értelmetlen lenne.
Még megpróbálom végiggondolni, hogy is lehetne törölni a könyvtár méretét.
update:
tree -hnNIF . | sed -r 's/(^.*)\[.*\](.*\/$)/\1\2/'
vagy
tree -hnNIF . | sed -r 's/(^.*)\[.*\](.*)\/$/\1\2/'
Kb. így...