Én két utat látok, illetve hármat.
1) SSH-n keresztül rsync minden éjjel és persze SQL-ről dump előtte, amit exclude-olhatsz is. Az SSH-t AllowUsers X@ipcim formában konkrét IP-re tudod kötni és egyébként nem árt az egyedi port alkalmazása sem, de az egyedi porttól biztonságos nem lesz. Egyszerűen kulcsos auth-al beereszted a juzert és kész.
2) A lentebb írt rsyncd-s opció, de ott megnézném, hogy tudja-e tömöríteni a kapcsolatot az rsync és hogy mennyire cleartext. Egy AES-128-as OpenVPN tunnel hasznos lehet, mert az tömöríti is a forgalmat ebben az esetben.
3) Ha esetleg ZFS-t használsz, akkor van zfs send és zfs receive opció, amivel snapshotokat lehet akár másik gépre is átküldeni.
A forgalmad nem lesz veszélyesen magas, úgyis a havi átlagot nézik a szolgáltatók. Amire figyelni kell, hogy ha ennyire sokminden van, akkor ne érjenek egymásba a mentések, mert az roppant kellemetlen lehet.