Én a következőt javasolnám:
A mentendő gépen indítsd szervízként (873-as port) az rsync-et majd konfiguráld úgy, hogy csak read-only és csak a backup szerver IP címéről fogadjon kapcsolatot User/Pass azonosítás (ami nem kell, hogy root legyen) után.
(1) a mentendő gépen logikai adatbázis dump készítése a távoli gépre mentés előtt
(2) a backup gép kapcsolódjon a mentendő szerverhez és hozza szinkronba az előző mentést a jelenlegi szerver állapottal. Esetleg hardlinkes kapcsolókkal több állapotot is megtarthatsz csak a változások méretét használva.
Így egy-egy mentés rövid idő alatt lemegy és a teljes fájlrendszeredről van komplett másoladod, beleértve az adatbázis logikai mentéseket is.
--
maszili