Az error logot nézd meg, hogy benne vannak-e a 404-ek, ha igen, akkor látod, hogy mit nem talál, azokat kell előkeresni a lighttpd konfigjából vagy valahonnét, mert nekem pl. nincsenek apache alatt semmiféle aliasok vagy valamik. Illetve érdemes megnézni, hogy mit mond a konkrét hiányzó fájlokra (nincs ott, nincs access, miegyéb) maga a browser.
Elő kéne kotorni, hogy a sqlbuddy hová ír logot és mi a konkrét baja - azzal már meg is lenne a válasz kb.
Illetve ha minden kötél szakad, akkor kéne az a lighttpd konfig ami még működött.