Én találkoztam teljesen hasonlóval.
Az volt a megfejtés, hogy binárisból telepítettem egy olyan programot, ami a saját lib könyvtárában hozta magával azokat a Qt könyvtárakat, amelyekre neki szüksége volt, ezek azonban nem voltak azonosak a rendszer által használt verzióval.
Miután fölvettem a dinamikus könyvtárak keresési útvonalai közé, ő kiválóan működött, viszont gyakorlatilag minden más megállt, ami a Qt-re támaszkodott és ilyeneket üzengetett.
A megoldás a kérdéses alkalmazás forrásból való újrafordítása volt azzal a Qt-vel, amit maga a rendszer tartalmazott.