Gondolom azért nem lőtted le a biztonsági mentést, mert elölről kellet volna kezdeni.
Ez esetben ajánlom figyelmedbe az "rsync -va --delete /honnan/ /hová/" parancsot, mely ott folytatja ahol abbahagytad + ha rendszeresen backupolsz, csak a változásokat tolja át/törli le.