Sose próbáltam, de talán működik. Mivel a gond a sok kis file megnyitása-lezárása, ezért az egész fs-t kéne vinni, pl. dd-vel:
dd if=/dev/egyikdisk of=/dev/masikdisk
Persze ez csak akkkor jó, ha nem akarsz fájlrendszert módosítani, és a második disk nem kisebb mint az első. LVM rulez. Ha két gép között kell áttolni, akkor google("netcat examples");