Értem, de ezeket én soha nem próbáltam. Azt viszont egy linux-szal rögtön ki lehet deríteni, hogy a gond a mérete a pendrive-nak vagy valami más!
Telepítsd a netbootin-t, aztán egy netinstallt tolj a pendrive-ra vele amikor van rajta partíció és nézd meg bootol-e. Ha nem, akkor formázd partíció nélkül és ismét told rá a telepítőt. Ha bootol bármely esetben, akkor utána kell piszkálni a grubot, addig azt se tudod mi okozza a hibát...szerintem.
A netbootint azért ajánlom, mert
1, nem kell átírogatni az isolinux-ot syslinux-ra és turkálni a tartalmában, így az elírás mint hiba kizárható
2, rögtön leszed neked a netről egy akármilyen kicsi netinstall-t, ami biztos működik a pendrive-ról.
Ez kb 10 - 15 perces meló és mindjárt egyértelműbb lesz a hiba...
üdv: pomm