Nekem pl. az OpenOffice is kb. 3-4x annyi idő alatt megy le, mint fel (nem szeretem, amikor 4-5 verzió van a gépen :)
Soha nem foglalkoztam a Windows Installer lelkivilágával, de a dolog valószínűleg arra vezethető vissza, hogy míg a a linuxos csomagkezelők lehetetlenné teszik, hogy két csomag ugyanolyan fájlnevet tartalmazzon (beleértve az elérési utat is), addig a Win alatt ez simán lehetséges, ezért amikor felraksz valamit, csak kikiabál, hogy ilyen fájlod már van, amikor viszont leszeded, akkor végig kell néznie az összes (un)install-információt, hogy másnak nincs-e szüksége rá. Na, ez tarthat sok ideig...