Szerintem félreérted, hogyan működik a helm subchart-ban lévő value-k kezelése. A subchart (mariadb) value-kra példa az nem lesz benne a semaphore values sample-nél. De attól, hogy ott nincs benne, attól még a mariadb subchart-ot egy konkrét verzióval hivatkozza be, ezért ez egy teljesen jól definiált és supportált dolog, hogy milyen value-val tudod megmondani, hogy mondjuk mi legyen a mariadb docker image. Ez nem számít "eltérésnek" a sample chart-tól. Az erre vonatkozó sample a mariadb chart adott verziójánál lesz.
Lásd https://helm.sh/docs/chart_template_guide/subcharts_and_globals
És ez nem okoz semmilyen gondot a későbbiekben (kivéve esetleges főverzió ugráskor, de olyankor normális, hogy akár a főchart-ban, akár a subchart-ban máshogy vannak a value-k).