Már miért lenne baj, és kinek? Akinek kell az AUR, az igénybe tudja venni, annak nem baj. Aki meg nem bízik benne, az nem használja, nem veszi igénybe, használ helyette másfajta csomagokat, annak meg azért nem baj.
AUR-hoz hasonló forrás van egy pár disztrón, Void-on a void-src, Gentoo-n az overlay-ek, Fedorán a Fusion, stb.. De az AUR a legnagyobb, lényegében az összes létező, Linuxra elérhető vagy Linuxon futtatható szoftvert lefedi, olyat te nem nagyon találsz, ami vagy a hivatalos tárolókban vagy az AUR-ban nincs meg. Debian, Ubuntu, és származékain gond, hogy ilyen nincs, ott viszont vagy PPA-k vannak, vagy univerzális csomagformátumokkal lehet kiegészíteni, ami bloat, lehet lassabban indul, de azért több, mint a semmi. Nem fednek le mindent, egy csomó kisebb ablakkezelő, CLI/TUI tool pl. nincs meg a Debian/Ubuntu tárolójában, és ezekre a Flatpak, Snap, Appimage se jó, mert azok GUI programokhoz vannak. CLI/TUI megoldásokra ott vagy a konténer vagy a virtualizáció marad.